Cari Blog Ini

Laman

Selasa, 27 Mei 2014

Ke Inggris Gratis sebelum Jadi Sarjana Sains


Inggris, negeri Ratu Elizabeth. Siapa coba yang nggak pengen jalan-jalan gratis kesana. Bukan cuma pemimpi dan traveller, penggila bola apalagi. Negeri yang terkenal dengan Liga Premiernya pasti jadi tujuan utama fans football club Inggris yang terkenal seantero jagad. Ya, sebagai suporter yang kebetulan mencintai Manchester United, tentu kesempatan buat keliling Inggris gratis nggak boleh dilewatkan begitu saja. Iming-iming nyicipin suasana Manchester langsung bikin semangat buat nulis. Bukannya bisa ke Inggris dengan paket wisata agen travel? Yah,,tentu bisa saja. Tapi jelas, tantangan untuk menulis dan memenangkan kesempatan jalan-jalan ke Inggris itu pasti jadi pengalaman berkesan dan tak terlupakan, apalagi kalau bisa berangkat beneran, sekali seumur hidup.
Gabungan semangatnya traveller, suporter, dan sedikit blogger mendorong saya buat menuliskan sebagian mimpi soal main-main ke Inggris. Pengaruh rasa penasaran dengan tempat-tempat baru, keinginan menikmati suasana Old Trafford langsung dan aura magis Theatre of Dreams, juga semangat cuap-cuap lewat tulisan, akhirnya dapat juga dilampiaskan lewat ajang #InggrisGratis. Selain itu, lecutan semangat dari quote dosen penguji yang mengatakan bahwa, mumpung masih muda, bepergianlah. Temui tempat-tempat baru yang bakal menambah ilmu. Dan akan saya buktikan, saya bisa pergi ke tempat-tempat yang saya impikan, dan menemukan ilmu-sahabat baru disana. Sebelum menghadapi beliau di sidang skripsi nanti, kira-kira pengalaman perjalanan ke Inggris bisa saya bagi dengan beliau, dan saya bisa membuktikan kalau saya bisa ke Inggris walau belum bertitel sarjana. Hehehehe. Karena kebetulan saya belajar di jurusan sains murni, kimia, jadi agak-agak lumayan susah buat nyusun tugas akhir. Makanya, kegiatan nulis sambil iseng menggadaikan peruntungan, siapa tahu kecantol pemenang dan bisa jalan-jalan ke #InggrisGratis. Juga ada perasaan bangga tersendiri kalau bisa lolos kompetisi ini. Bisa keluar negeri dalam rangka tidak untuk belajar adalah prestasi tersendiri buat mahasiswa kimia yang dikenal cukup “kutu buku”. Ah, semoga saja tulisan kecil ini mampu menghanyutkan hati juri buat mengikutkan saya di rombongan jalan-jalan ke#InggrisGratis
Seringkali pak dosen cerita soal beliau yang udah kemana-mana. Jalan-jalan keluar negeri sambil belajar, tapi siapa takut terima tantangan nulis, kalau hadiahnya bisa jalan-jalan keluar negeri. Mewujudkan kenyataan dari cerita pak dosen yang cuma pamer, jadi semangat buat dapetin peluang jalan-jalan #InggrisGratis. Se’semangat’ ngabisin Smax Rings cheese flavor yang enak dimakan, kapanpun dimanapun J




Kamis, 10 April 2014

they are "twins"

si pebalap Rio Harianto <3 br="">
si news anchor, ko Robet Haryanto <3 td="">
kenpa tiba-tiba pengen nulis suatu kenyataan yang tidak terbantahkan dalam hidup. yes of course...kenyataan ini berawal dari pemikiran konyol yang tiba-tiba nyambung membentuk bangun ruang yang sayang buat dilupakan.
sampe susah harus nulis dari mana ( ._.)/
dulu..dulu banget pernah suka sama kakak kelas. biasaaa cinta-cintaan anak smp. cinta monyet kata orang jaman sekarang. dan wajahnya itu model2 jet li..sipit2 manis gitu <3 awal="" ber-alis="" cowok2="" cowok="" dan="" dari="" emang="" kagum="" kebawa="" model2="" oriental="" p="" pedang.="" sama="" sampe="" sekarang="" sipit="" suka="">sampai suatu hari..suatu hari yang bener2 lupa kalo pernah suka sama kakak ini, di jaman lagi suka2nya scroll timeline soal bola-balap2an, nemu (jiaaa nemu) sosok favorite ini. cowok (jelas lahhh -___- ), ganteng,  yang kebetulan hobi balap-balapan: Rio Haryanto. ooh menn...keliling-keliling gugel, searching fanpage di fb dan twitter, nemu semua yang dibutuhin kaum kepoers. hot pict, video2, daaan semuanya,dalam sejam rasanya udah kenal dan shanggup jadi pacarnya Rio ini.
hampir setahun, kesetanan kepoin Rio Haryanto dan segala pernak-perniknya, tiba-tiba dengan hati riang gembira..saya dipertemukan dengan the other Harianto :D
selain ganteng, R. Harianto satu ini juga punya kerjaan favoritku. News Anchor....
oh my God... kenapa dua orang yang namanya mirip ini juga sama2 mirip wajahnya. sipit, alis pedang, suaranya berat..duuh makin mabok aja googling nyari info kedua R. Hariyanto. satunya Rio Haryanto satunya lagi Rio Harianto..sama2 ganteng..sama2 berprestasi..sama2 kegilaan klo udah nongkrongin tv yg nayangin mereka.
apapun alasannya menurut ku mereka MIRIP

Aku Memintamu Tersenyum Sekarang, Sayang


#kisah ini fiktif belaka. kesamaan nama tempat kejadian mirip2 gitu bukan kesengajaan. itu cuma imajinasi penulis. happy reading...
#note lagi. tulisan ini dibuat untuk mengikuti ajang penulisan. jadi penulis sebenarnya masih single :D
Aku tidak pernah meminta kamu, lelaki yang  menjadi imam saat ini dan di masa mendatang untuk selalu menghadirkan senyum. Tambah lagi, kehadiran abang yang mirip sekali denganmu membuatku seolah tak ingin minta apa-apa lagi selain hadirmu. Sayang, tahukah, hari ini mungkin baru kutemukan mengapa, setiap kamu diam dan memperhatikanku, aku merasa jatuh cinta. Karena dalam diammu itulah aku segalanya buat kamu.
            Selalu, tatapan mata lucu kamu membangkitkan semangat meminta, agar Allah berkenan menjaga kamu dan aku selamanya dalam rahmat-Nya. Karena itu, tiap lelah sehabis mengurus abang  seharian, aku menunggu teduh matamu menentramkan hatiku. Lucu juga, kadang aku kesal tiap kamu seolah acuh melihat aku repot dengan urusanku. Padahal aku tahu, kamu sendiri tak kalah repot dengan segala isi pikiran yang menyita waktu. Soal aku, abang, ayah ibu di rumah, pekerjaan, dan urusan lainnya yang aku tahu kamu belum pernah mengeluh karenanya. Lalu kesal itu menguap begitu saja saat kita nonton Liga Inggris yang menghadirkan big match bersama-sama. Malam yang aku niatkan ngambek karena seharian kamu cuek, berubah jadi ceria lagi.  Disertai berantem kecil soal keputusan wasit, yang jelas-jelas aku sok tau soal itu, tapi kamu cuma ketawa. Akulah wanita paling beruntung, karena bersuamikan kamu, yang penggila sepak bola, tapi tak pernah merasa sok tahu soal sepak bola.
            Kalau aku ceritakan soal keberuntunganku akan hadirmu, mungkin tak cukup tulisan ini merangkum semuanya. Cukup aku senyum-senyum setiap hari, karena syukurku yang tak pernah habis. Menyayangi serta mencintai kamu dan abang adalah hal paling membahagiakan. Sering aku meminta ini itu pada Allah, padahal aku sudah memiliki segalanya, kalian. Hanya kadang aku takut sayang. Kasih sayang yang Allah titipkan lewat penyakitku, banyak menghabiskan jatah waktuku bersamamu. Kamu tahu kan, ya kamu selalu menyemangatiku bahkan, komplikasi diabetes mellitus yang mulai menemaniku sejak 10 tahun lalu, akan segera mengakhirkan ini. Ah, tapi aku tak mau berburuk sangka. Toh kamu selalu menghadirkan harapan untuk selalu sehat. Untuk selalu bahagia bersamamu dan abang.
            Aku tidak pernah meminta kamu mengadakan acara romantis, tapi kamu menghadirkan lebih dari itu. Kalau aku sudah gelisah karena hiperglikemia, aku tidak bisa menyembunyikan keharuan, memandang wajahmu yang cemas. Maaf sayang, aku tidak bermaksud membuatmu khawatir. Lalu kamu yang menenangkanku, mengatakan semua akan baik-baik saja. Hehehe…kamu tahu, wajah kamu lucu kalau sedang cemas begitu. Disatu sisi aku terharu karena merepotkanmu, tapi disisi lain aku ingin tertawa. Bukan, bukan karena ada hal yang lucu, tetapi aku tidak ingin melihat kamu sedih karena melihatku menangis, takut meninggalkanmu dan abang sendirian.
            Ini sudah beberapa hari aku tidak bisa menemani kamu dan abang di rumah. Saran dokter untuk menjalani rawat inap karena ada sesuatu yang salah dengan sistem ginjalku, harus dengan terpaksa aku ikuti. Sebenarnya lebih berat meninggalkan kamu dan abang sendirian di rumah. Tapi kamu meyakinkanku, kamu bisa mengurus semuanya. Dan ini bukan pertama kalinya aku harus meninggalkan kalian sementara seperti ini. Selalu, kamu dengan sabarnya menggantikanku di rumah. Meskipun sebenarnya aku lebih suka kamu dan abang berada disini saja. Sayang,maafkan aku…
            Padahal kamu sendiri sedang lelap disampingku. Menunggu cairan infus habis dan memanggilkan suster untuk menggantinya. Aku tak ingin membangunkanmu, tapi saat ini aku ingin melihat kamu tersenyum. Menatapku teduh, dan meyakinkan semua akan baik-baik saja. Aku ingin membisikkan bahwa dini hari nanti aku mau nonton bola sama kamu, tertawa-tawa menyalahkan wasit, lalu berteriak karena jagoanku lolos final Liga Champion. Lalu memintamu mengimami subuh nanti, walau aku harus sholat sambil terbaring. Sayangku, suamiku tercinta, aku ingin memintamu tersenyum sekarang…



Selasa, 09 Juli 2013

seandainya aku ada di bagian dunia lain tanpa kalian

ini sebenernya late report. hehehehe. maksudku udah lama pengen nulis ini, tapi selalu belum sempat. ditengah stuck bikin laporan magang, pengen refreshing sambil mengingat kejadian ajaib yang terjadi, karena aku berada disini, bersama kalian..

dua cerita ini temanya sama. sama-sama soal ketemu idola.

yang pertama kesempatan ikut seminar Indonesia Mengajar, April 2012. dan karena pembicaranya salahs seorang tokoh nasional yang inspiratif, bapak Anies Baswedan , aku semangat banget ikutan acara ini. dimotori Minin, dian, tia juga. akhirnya kesampaian juga ketemu bapak ini. yang seru itu pas waktu berebut kedepan minta ttd pak anies di buku. kalo ga gara-gara tia semangat banget dorong-dorong aku buat maju dan minta ttd, aku pasti udah nyerah. membiarkan buku Indonesia Mengajar jilid I kosong tanpa ttd pak anies yang sekarang santer dikabarkan bakal jadi capres 2014.
karena semangat 45 temen-temen, akhirnya aku dapet ttdnya. rasanya puass.. dan langsung aku peluk Tia. karena tia yang maksa maju buat dapet ttd itu. aaaakkk..senengnya :D thanks Tia, Dian, Minin juga :D 


yang kedua, kejadian baru-baru ini. tepatnya tanggal 23 Juni 2013. waktu itu udah denger kabar kalau Nidji mau manggung di jember. ga nyia-nyiain kesempatan, langsung samber info sana-sini. sampe akhirnya ketemu temen-temen nidjiholic jember. dan yeaah..gue gabung disana. 
singkatnya, karena ga ada kawan waktu itu buat temenin nonton, akhirnya minta tolong pak agung. untungnya dia gak lagi sibuk press conference atau kegiatan keartisannya lagi break. jadilah sementara tak sewa jadi supir :p
 berangkat dengan penuh keragu-raguan, tapi akhirnya nyampe gor juga. meskipun saat itu masih gambling, bakalan ketemu nidji nya atau engga. udah hampir putus asa gara-gara capek muter2 ambil tumpeng, beli oleh2, nunggu, tapi kalo inget semangatnya temen2 dan kesempatan ketemu nidji yang ga mungkin terulang lain waktu, juag perjuangannya om agung yang muter2 bawa blacky buat jemput aku, bikin masih bisa bertahan sampe sekitar jam 8 an malem. setelah nunggu lebih dari 4 jam...akhirnyaaaa..dengan kegigihan temen-temen nidjiholic jember, sama bantuan dari salah satu managernya nidji, gue berhasil ketemu. eksklusif, langsung disambut pas di venue
rasanya kaki lemes,,,liat gantengnya giring sama manisnya ariel u,u
perjuangan ku, agung, dan temen2 nidjihoic ga sia-sia. kita dapet foto eksklusif, peresmian nidjiholic jember, dan foto-foto keren bareng personilnya nidji. aaaaaaaaaaaaakkkk......
sayangnya ga ada orang yang bisa gue peluk abis dapet foto eksklusif sambil dipeluk giring :3
pulangnya, sambil nyamperin agung yang udah nunggu, aku kayak orang gila, norak , gara2 abis foto itu. dengan muka kumus-kumus, akhirnya cuma bisa teriak-teriak di depan agung..makasihhh ooooom :D

moralnya: gue gak mungkin bisa senorak ini, seheboh ini, kalau gue ada di belahan dunia lain bukan bersama kalian. cerita yang Allah tulis begitu rapinya sampai gue baru nyadar kalo ada kalian disini, itu cerita hidupku paling berharga. coba kalo gue ga bareng atau ketemu kalian...mana mungkin bisa nulis notes secepet ini (padahal ini nyambi bikin laporan magang :D) . terimakasih kawan....semua rahasia Tuhan itu menyenangkan, kalau kita bisa menemui moralnya... 



Jumat, 26 April 2013

what the love means

pernah merasa dicintai sepenuh hati?
siapa lagi kalau bukan dengan orang kita sayang juga
mereka yang dekat dengan kehidupan sehari-hari kita
kadang terlewat oleh kita senyumnya...semangat mereka buat kita
kadang saat kita lupa, mereka cuma bisa menyimpan, menyimpan sendiri
tanpa tahu mereka pun menyimpannya. menunggu kita untuk meminta bukti, bahwa kita juga mencintai mereka.
cinta yang selama ini tak tampak, padahal nyata di depan.
susah dituliskan lewat kata-kata
hanya mampu diungkap lewat doa
untuk dia yang jauh disana
semangat menggapai cita-citamu
semangat membuktikan dirimu juga mampu
kamu hebat sayang :*


my lil sista
Lanthika Dwi Ikhsanti

Rabu, 24 April 2013

gurau galau

apa sih yang bikin hidup berwarna kalau bukan pernah jatuh, pernah senang, pernah terbang, pernah sakit?
jadi hidup itu akan berasa lebih menggigit kalau sudah pernah merasa senang, sakit, lalu senang lagi.
well, life akan lebih berwarna kalau ada banyak 'warna' dalam coretan kita. mau warna pastel, cerah meriah, atau kusam, semua kita yang menuang dan orang lain yang merasakan makna 'warna' yang kita torehkan pada kehidupan :)
kemaren saat banyak tugas menumpuk, pengen nulis di social media, tapi jadi kelihatan kayak orang bingung kalo nulis setengah-setengah gitu :3
akhirnya sekarang bisa nulis. entah tulisan apa ini, tanpa kerangka-kerangka tulisan
andai menulis laporan, BAB 1 skripsi juga semudah menulis apa yang dipikiran, segampang cuap-cuap di twitter.
dan ternyata banyak tawa yang terlewat, bahkan ga sadar ketika ada banyak teman2 yang ngajak ketawa. bahagia itu sederhana, kalau kita mau peduli dan melihat apa yang nyata dan mensyukuri semuanya :)
love you all guys

Kamis, 07 Maret 2013

new life

hai...
liburan lagi, aku pergi ke beberapa langkah jejak dunia. eh,terlalu jauh deng. Indonesia. kayak terinspirasi dari cerita traveller-traveller yang sering aku baca. aku pengen suatu hari seperti mereka. menghabiskan waktu menikmati pemberian Tuhan lewat tempat2 indah yang tercecer di bagian negeriku. Hari ini aku ingin berbagi. langkahku tertuju di tempat bersejarah. sisa-sisa peradaban majapahit yang megah. akhirnya sampai juga aku ke kota ini. dengan modal nekat, dan sedikit keberanian yang tersisa. ditambah kegalauan yang bersarang sejak sebelum keberangkatan.
ah, menyedihkan. tapi memang harus begini, jalan kesana tak ubahnya alur cerita maju mundur. setelah senang akan munculnya harapan baru, tiba-tiba secepat itu juga mati lagi. tapi ini hidup, kalau sudah jatuh, harus berani bangun lagi.
lah, kok jadi ngelantur curhat :3
oke,, jalan-jalan singkat saya ini bisa diangkum lewat foto-foto. diambil oleh seorang teman yang bersedia jadi tour guide selama mbolang. terima kasih :)



namanya candi brahu, masih dalam kompleks kerajaan majapahit. senja di balik candi brahu unforgetable banget. apalagi kalau cerah. sayang sekali pengunjung dilarang naik ke atas candi. tapi menikmati kompleks candi brahu sore-sore gini itu, asik (y)

dan tentu saja. buah maja. buah asli yang pahit ini tentu jadi icon dari majapahit. banyak ditemukan di sekitar kompleks candi. penampilan yang nampaknya cukup 'aman' untuk dikonsumsi ternyata mampu menarik perhatian prajurit yg dulunya bekerja keras membuka hutan tarik untuk mendirikan wilayah, yang akhirnya dinamakan 'majapahit'

dan satu lagi, icon yang tidak boleh terlewati kalo kesini. mahapatoh gajah mada. patung yang terletak di tempat yang disebut pendopo ini jadi icon penting yang tidak bisa lepas dari nama besar majapahit. jayanya kerajaan nusantara I juga tak lepas dari peran patih gajah mada. berada disini seperti terseret dalam pusaran sejarah yang tidak pernah habis memotivasi. seperti monumen berikut, yang baca isinya aja saya merinding, karena ini bagian sejarah negara saya. dan saya juga menjadi bagian dari sejarah tersebut, setidaknya dengan mengunjungi peninggalannya sekarang
hehehehe...masih kurang banyak dokumentasi sebenarnya. danau tempat yang katanya untuk mencuci piring kerajaan belum sempat saya foto. juga candi terkenal lainnya, seperti candi tikus. tapi, berdiri diatas peninggalan sejarah yang sebelumnya cuma bisa saya baca di buku pelajaran, adalah satu hal lain yang membuat saya bangga bisa berada disini. let's travelling again, masih banyak harta karun di Indonesia yang belum saya jelajahi. see yaaaaa.....

Sabtu, 08 Desember 2012

Enzim Alanin Racemase


1.      Enzim sebagai Materi
Enzim adalah salah satu komponen dalam makhluk hidup yang berperan penting dalam menjalankan dan mengatur perubahan kimia dalam suatu sistem biologi. Enzim dihasilkan oleh organ-organ makhluk hidup dan terdapat di dalam bagian sel. Suatu enzim tersusun dari protein karena memiliki sifat-sifat seperti protein, yaitu sensitif terhadap suhu (thermolabil), serta membutuhkan kondisi pH yang sesuai. Enzim memiliki sifat yang khas sebagai katalis, yang sangat menentukan kerja suatu sel. Enzim bekerja secara reversibel atau bolak-balik. Serta bekerja secara spesifik pada satu substrat.
Enzim secara umum diklasifikasikan dalam enam kelas. Yaitu :
a.       Oksidoreduktase
b.      Transferase
c.       Hidrolase
d.      Liase
e.       Isomerase
f.       Ligase
Enzim yang termasuk dalam kelas isomerase bekerja pada reaksi pemindahan satu gugus fungsi di dalam suatu molekul membentuk isomer. Enzim isomerase diklasifikasikan lebih spesifik menurut jenis reaksinya. Antara lain :
1. Rasemisasi atau epimerisasi
2. Isomerisasi cis-trans
3. Oksidoreduktase intramolekul
4. Reaksi transfer intramolekul
Tata nama Alanin rasemase menurut Commision on Enzymes of The International Union of Biochemistry berdasarkan fungsinya, yaitu

EC 5.-.-.- Isomerase
      EC 5.1.-.- Rasemase dan Epimerase
                  EC 5.1.1.- berperan dalam asam amino dan turunannya
                              EC 5.1.1.1 Alanin rasemase
Alanin rasemase terdapat pada beberapa jenis bakteri dan terletak di dinding sel bakteri (peptidoglikan) yang berfungsi untuk mengkatalis interkonvensi L- menjadi D- alanin. Gugus kofaktor ( gugus bukan protein yang terikat pada enzim) pada alanin rasemase adalah gugus pyridoxal 5’-fosfat (PLP). Pada sisi aktif enzim terdapat asam amino Tyrosin (265) dan asam amino Lysin (39). Inhibitor pada enzim ini adalah alanin fosfonat dan D-cycloserine. Alanin fosfonat merupakan inhibitor bersaing karena memiliki struktur yang mirip dengan substrat (D-alanin) dan dapat membentuk kompleks dengan enzim. Inhibitor D-cycloserine berikatan dengan enzim atau pada enzim yang telah mengikat substrat, sehingga menghambat reaksi enzim.
Alanin rasemase membentuk homodimer yang mana monomer membentuk asosiasi pada kepala hingga ekor yang terlihat khas pada alanin rasemase. Masing – masing monomer memiliki delapan domain α-stranded /β barel (residu 1-238) dan domain β-untai yang diperpanjang (residu 239-367). Pada satu monomer L-alanin berada pada letak yang berdekatan dengan monomer  domain β-untai . meskipun kedua monomer memiliki lipatan yang sangat morip namun kedua monomer ini memiliki bentuk kristal yang berbeda dan simetri kristal yang tidak dgunakan dalam penyempurnaan. Perbedaan antara Cα dari kedua monomer setelah mengalami super posisi yaitu memiliki panjang gelombang 0,38Å, dan A dan B masing-masing memilki faktor 38,4 dan 46,9A2.
Pada alanin rasemase pyridoxal-5-fosfat terhubung ke lysin 39 melalui ikatan aldimine internal yang berada di dalam barel domain α/β. Seperti yang ditunjukkan pada gambar dibawah ini:
Gambar di atas menunjukkan strutur alanin rasemase pada gambar A monomer dari alanin rasemase di tunjukkan dengam warna hijau dan warna emas. Warna emas merupakan monomer β dan warna hijau merupakan monomer α. Pada gambar B pita diagram  dimer alanin rasemase yang mana menggambarkan struktur monomer-monomer pada alanin rasemase. Pada monomer satu berwarna merah dan monomer kedua berwarna biru. Pada gambar struktur A menunjukkan bahwa kofaktor pyridoxal-5-fosfat (PLP) terikat secara kovalen pada lysin 39 yang digambarkan dengan bola-bola hitam yang berada pada sisi aktif.
Enzim alanin rasemase bekerja secara optimum pada suhu 230-370 Celcius. Sedangkan pada pH ±7.0 enzim ini dapat bekerja secara optimal. Pada suhu yang rendah mendekati titik beku enzim tidak akan rusak namun enzim alann rasemase tidak aktif (inactive). Namun dengan adanya kenaikan suhu lingkungan, enzim mulai bekerja dan mencapai suhu maksimum pada suhu tertentu yaitu 230-370 Celcius enzim alanin rasemase akan bekerja optimum. Apabila suhu ditingkatkan terus,jumlah enzim yang aktif akan berkurang karena terjadi denaturasi. Kecepatan reaksi enzimatik mencapai puncak pada suhu optimum.
Enzim bekerja pada kisaran pH tertentu. Kecepatan reaksi enzimatik mencapai puncaknya pada pH maksimum. Pada alanin rasemase bekerja  maksimum pada pH ±8,3.  Apabila pH lebih dari ±8,3 enzim alanin rasemase akan mengalami denaturasi. Selain itu pada keadaan ini baik enzim maupun  substrat akan mengalami kenaikan muatan listrik yang mengakibatkan enzim tidak dapat berikatan dengan substrat yaitu L-Alanin. Pada pH maksimum ±8,3 alanin rasemase akan mengambil struktur 3 dimensi yang sangat tepat sehingga ia dapat mengikta dan mengelolah substrat dengan kecepatan yang setinggi-tingginya. Di luar pH maksimum alanin rasemase struktur 3 dimensi ini akan mulai berubah sehingga substrat tidak dapat lagi berikatan tepat di bagian molekul enzim yang mengelola substrat. Akibatnya proses katalitik tidak akan berjalan dengan optimum. Oleh karena itu struktur 3 dimensi berubah akibat pH yang tidak optimum. Berikut adalah struktur susbtrat D-alanin dan produk L-alanin serta kofaktor PLP (pyridoxal 5’-fosfat).






Dan dibawah ini adalah struktur inhibitor D-cycloserine







2.      Enzim sebagai Katalis
Salah satu fungsi enzim yaitu sebagai katalisator, yang mana enzim berperan mempercepat reaksi tanpa ikut larut dalam reaksi namun dihasilkan kembali sebagai produk. Alanin rasemase merupakan enzim penting dalam bakteri. Alanin rasemase (Alar) mengkatalisis interkonvensi antara L-Ala dan D-Ala dengan bantuan kofaktor pyridoxal 5’-fosfat (PLP). Nitrogen piridin di PLP tidak terprotonasi karena berinteraksi dengan Arg219 pada sisi aktif D-alanin. Dengan gabungan mekanika kuantum dan mekanika molekul yang dapat mengetahui peningkatan keasaman karbon dalam reaksi rasemisasi alanin dikatalisis oleh alanin rasemase. Gabungan dari mekanika kuantum dan mekanika molekul ini menunjukkan bahwa peningkatan keasaman karbon α-asam amino oleh pyridoxal kofaktor 5’-fosfat (PLP) dan piridin, tidak terprotonasi karena adanya efek solvasi, berbeda dengan stabilitas intrisik elektron menarik ion piridinium untuk membentuk intermediet quinonoid. Kemudian alanin rasemase menurunkan keasaman α-proton dan menyediakan 14-17 kkal/mol untuk stabilitas transisi.
Efek dari kofaktor pyridoxal 5’-fosfat (PLP) pada aktivitas dan stabilitas alanin rasemase, memiliki aktivitas katalitik yang tinggi pada suhu rendah namun pada psychosaccharolyticus Bacillus aktivitas yang tinggi terletak pada suhu tinggi. Penurunan aktivitas enzim pada suhu inkubasi yaitu lebih dari 40°C adalah konsisiten pada penurunan jumlah PLP yang terikat. Pada PLP 0,125 mM, aktivitas spesifik enzim psychorophilic lebih tinggi dari alanin rasemase termofilik, yang mana memiliki aktivitas katalitik yang tinggi pada suhu yang tinggi dari stearothermophilus Bacillus bahkan pada 60°C.

3.      Mekanisme Reaksi
Mekanisme reaksi alanin rasemase menggunakan dua katalis basa pada sisi aktif Tyrosin (265) dan PLP- Lysin (39). Lysin (39) yang terikat pada kofaktor berperan sebagai residu katalis yang meringkas atau mengurangi a-hidrogen dari L-alanin dan menambah a-hidrogen dalam gugus intermediet membentuk D-alanin. Substrat yang memiliki gugus karboksil turut berperan dalam katalisis sebagai media dalam transfer proton antara dua katalis basa. Reaksi melibatkan tiga langkah berurutan: (i) pembentukan intermediate tetrahedral dengan situs lisin aktif dan substrat amino terikat pada kofaktor PLP; (ii ) transfer proton tidak langsung antara substrat amino dan residu lisin, dan (iii) pembentukan aldimine eksternal
Pembentukan intermediet yaitu, nitrogen dari piridin dari PLP diprotonasi, dan membentuk ikatan hidrogen dengan bentuk anionik residu asam amino. Ion pridinium dari PLP bertindak sebagai elektron yang menstabilkan intermediet karbanion dengan membentuk spesies quinonoid. Kemudian, dilanjutkan dengan tahap kedua yaitu transfer proton. Transfer proton ini cenderung membentuk suatu gugus aromatik 6 cincin. Selanjutnya, gugus karboksil yang menerima proton menyumbangkan protonnya kepada gugus e-amino, Lysin (39). Selanjutnya, tahap ketiga dari reaksi ini adalah pembentukan gugus aldimine eksternal sebagai gugus yang membantu transfer proton. Gugus hidroksi fenol dari tyrosin (265) melepaskan a-hidrogen dari L-alanin dalam gugus aldimin eksternal dengan PLP, dan memberikan proton kepada gugus karboksil dalam aldimin. Selanjutnya, proton yang diterima gugus ini menyebabkan berubahnya cahaya terpolarisasi menjadi D-alanin. Sehingga membentuk isomer optik yang simetris.
Aldimine adalah imina yang terbentuk dari amina dan aldehid. Adisi nukleofil dari amina ke gugus karbonil yang diikuti dehidrasi. Mekanisme dimulai dengan protonasi oksigen karbonil yang menyebabkan karbon karbonil menjadi elektrofil yang baik. Selanjutnya amina menyerang karbon karbonil, kemudian proton ditransfer ke oksigen . Pasangan nitrogen tunggal kemudian membentuk ikatan pi dengan karbon dan memindahkan air dengan eliminasi, meninggalkan nitrogen bermuatan positif yang diprotonasi oleh basa.









4.      Kinetika Reaksi Enzim

Mekanisme reaksi enzimatik untuk sebuah subtrat tunggal. Enzim (E) mengikat substrat (S) dan menghasilkan produk (P).
Kinetika enzim menginvestigasi bagaimana enzim mengikat substrat dengan mengubahnya menjadi produk. Sifat kinetik AlrSP pada rasemase alanine bakteri dari L-alanin dan D-alanin dapat diketahui. Nilai Km untuk L-alanin adalah 1,9 mM. Nilai Km disini adalah konstanta Michaelis-Menten yang merupakan konsentrasi substrat yang diperlukan oleh suatu enzim untuk mencapai setengah kelajuan maksimumnya. Serta memiliki nilai Vmax untuk rasemisasi L-alanin menjadi D-alanin adalah 84,6 U/mg, Nilai Vmax disini menunjukkan semua sisi aktif enzim akan berikatan dengan substrat, dan jumlah kompleks ES adalah sama dengan jumlah total enzim yang ada, dimana dalam hal ini satu unit didefinisikan sebagai jumlah enzim yang mengkatalisis racemization dari 1 ìmol substrat per menit.
E + I              EI
ES + I              ESI

Pada kinetika ini,kofaktor yang berperan adalah PLP dan inhibitor yang berperan adalah D-cyclocerin. D-cycloserin akan berikatan dengan enzim atau substrat enzim. D-cyclocerin merupakan inhibitor non-kompetitif karena dapat emengubah konformasi enzim-substrat, dan mengakibatkan sisi katalitik enzim-substrat menjadi inaktif. Hal ini berarti bahwa kompleks enzim-substrat tidak dapat menghasilkan reaksi yang diharapkan.
Rasemase alanin oleh alanin rasemase melibatkan 2 reaksi abstraksi proton pada R-amino karbon oleh kedua basa lemah,yakni residu Tyr yang mengalami unprotonasi dalam ketika konversi L-ke-D alanin, dan residu Lys netral dalam L-D untuk isomerisasi. Dalam larutan berair, pKa keasaman karbon untuk asam amino zwitterionic seperti Gly adalah 28.9,61 sedangkan pKa untuk ion fenol dan etilamonium, mewakili sisi rantai Tyr dan Lys, adalah 10.062 dan 10.863. Berikut ini adalah tabel dan grafik dari energi bebas pada reaksi enzim alanin rasemase.



Abstraksi proton dengan ion phenolate dapat dianggap sebagai reaksi model dalam air untuk reaksi enzimatik yang sesuai untuk konversi L-ke D-alanine. Afinitas proton eksperimental tersedia untuk ion phenolate 64 dan untuk EtNH2 65 masing-masing 350,5 dan 219,9 kkal / mol dan memberikan validasi dari metode yang digunakan dalam perhitungan. Untuk deprotonasi uncatalisis dari alanin oleh phenolate ion dalam air, diperoleh energi bebas dari 30,9 kkal / mol menggunakan potensial SRP-AM1, yaitu sekitar 5 kkal / mol lebih besar dari nilai eksperimen ditentukan (25,8 kkal / mol) berdasarkan pKa nilai untuk glisin dan fenol. Harga  pKa untuk Ala, berdasarkan PMF dan nilai eksperimental untuk fenol, adalah 32,7  sebanding dengan nilai 28,9 untuk Gly.61 Reaksi energi bebas dari Ala-PLP (H +) tanpa protonasi pada nitrogen piridin dari PLP yang merupakan kofaktor, diperoleh energi bebas abstraksi proton sebesar 12,7 kkal / mol, dengan pKa prediksi 19,3 untuk R-amino karbon di Ala-PLP. Pada fase gas bebas  (energi bebas) dasar terkonjugasi dari Ala-PLP (H +) secara signifikan lebih kecil daripada alanin zwitterion. Sehingga, pembentukan piridin akan terprotonasi oleh spesies aldimin. Ala-PLP (H +), dapat  meningkatkan keasaman R-amino  dengan nilai  -65 kkal / mol. Namun, pembentukan Ala-PLP memiliki efek sebaliknya, dapat mengurangi keasaman karbon sebesar 36 kkal / mol. Ala- PLP dan PLP (H +) dengan  solvasi air, menghasilkan pKa dari 19,3(Ala-PLP (H +) ke 11,0 (Ala-PLP) . Dalam enzim alanin racemase, pasangan ion dan hydrogenbonding yang berinteraksi dengan residu di sisi aktif lebih menstabilkan dasar terkonjugasi dari aldimine eksternal Ala-PLP  yang akan berenergi sekitar 6 kkal / mol relatif terhadap proses berair. Menggunakan pKa (7.3) dari Tyr265  di Alar, yang lebih kecil dari pKa fenol dalam air (10,0), dapat dketahui juga pKa dari Ala- PLP adalah 12,2 dalam sisi aktif dari racemase alanin. Energi bebas keseluruhan reaksi konversi dari L-ke D-alanin adalah -2.8 kkal / mol.
a.      Pengaruh suhu terhadap kinetika enzim alanin rasemase
Enzim alanin rasemase bekerja secara optimum pada suhu 230-370 Celcius. Pada suhu optimum ektivitas dari enzim alanin rasemase mencapai nilai tertinggi, sehingga pada posisi inilah kecepatan reaksi mencapai posisi maksimal.  Pada suhu yang rendah mendekati titik beku enzim tidak akan rusak namun enzim alanin rasemase tidak aktif (inactive). Namun dengan adanya kenaikan suhu lingkungan, enzim mulai bekerja dan mencapai suhu maksimum pada suhu tertentu yaitu 230-370 Celcius enzim alanin rasemase akan bekerja optimum. Apabila suhu ditingkatkan terus,jumlah enzim yang aktif akan berkurang karena terjadi denaturasi. Kecepatan reaksi enzimatik mencapai puncak pada suhu optimum.
b.      Pengaruh pH terhadap kinetika enzim alanin rasemase
Enzim alanin rasemase bekerja pada pH optimum  ±8.3  Pada pH kurang dari ±8.3 sisi aktif enzim rasemase mengalami denaturasi secara perlahan sehingga aktivitasnya menurun. Dengan menurunnya aktivitas enzim rasemase, kecepatan reaksi akan menurun. pH optimum enzim alanin rasemase yaitu sekitar ±8.3 sehingga pada pH ini aktivitas enzim rasemase tinggi. Jika aktivitas enzimnya tinggi maka kecepatan reaksi akan tinggi pula.
Pada pH maksimum ±8,3 alanin rasemase akan mengambil struktur 3 dimensi yang sangat tepat sehingga ia dapat mengikat dan mengelolah substrat dengan kecepatan yang setinggi-tingginya. Di luar pH maksimum alanin rasemase struktur 3 dimensi ini akan mulai berubah sehingga substrat tidak dapat lagi berikatan tepat di bagian molekul enzim yang mengelola substrat. Akibatnya proses katalitik tidak akan berjalan dengan optimum. Oleh karena itu struktur 3 dimensi berubah akibat pH yang tidak optimum.
c.       Pengaruh inhibitor terhadap kinetika enzim
Inhibitor merupakan faktor penghambat kerja enzim. Ada beberapa jenis inhibitor yang dibedakan menurut cara kerja menghambat kerja enzim. Setiap enzim pasti memiliki inhibitor dan masing – masing enzim memiliki inhibitor yang bereda – beda. Menurut kelompok kami, inhibitor D-cycloserine akan berikatan dengan kompleks enzim-substrat  membentuk Enzim substrat-inhibitor. Adanya inhibitor akan mengurangi kereaktifan reaksi, sehingga mengganggu hasil reaksi yang diharapkan.

Kamis, 06 Desember 2012

petikan surat penting- Dahlan Iskan


menemukannya dalam buku yang menggebu untuk kubaca
kuhabiskan semalam untuk berkonsentrasi menggali motivasi
tak kusangka,ada bagian yang kira-kira sama dengan rasa yang akhir-akhir ini menyapaku
aku takluk dalam sepi
lalu mengartikan tiap bait yang tertulis..
hmm. aku bisa merasakan 'kehilangan' yang Pak Dahlan rasakan
kamu?
Barangkali harapan ini hanya semacam doa yang memeluk kehampaan sebagai kamu.
Tapi, biarlah...
Sesekali, waktu perlu mengajariku cara tercepat meninggalkan masa silam meski aku tak yakin kamu akan "hilang" begitu saja di masa depanku.
Kadang, setiap merindumu, aku menegarkan hati dengan merapal mantra "semoga", dan berharap mantra itu mustajab untuk mengembalikan "yang pergi" dan memulangkan "yang lupa".
Walaupun setiap mataku membuka, kamu "tetap pergi" dan "tetap lupa kembali"
Di jantung rinduku kamu adalah keabadian yang mengenalkan dan mengekalkan "kehilangan"

Tuhan memberkatiku, dengan pertemuan dan pertemanan yang hebat :)
Terima kasih....